低聚糖可以促进肠道内双歧杆菌及乳酸杆菌等有益微生物的增殖，同时抑制沙门氏菌与大肠杆菌等病原微生物的增殖，从而改善肠道微生态环境，它还可以改善脂质代谢，对蛋白质的代谢也有一定的影响;它也可以促进日粮中钙、镁、磷及铁的吸收;另外，它还可以为肠粘膜细胞提供能源，增进肠粘膜细胞的增殖，促进肠道发育。
低聚糖的开发研究以日本最早，品种也最多。80年代中后期，日本首先将低聚糖开发为饲料添加剂，到90年代中期，日本低聚糖全国产量的三分之一都被添加到饲料中去。目前日本有40%的仔猪饲料都添加了低聚糖。在欧洲，低聚糖虽然发展较日本晚，但欧洲各国对功能性低聚糖在人类和畜禽中应用研究非常重视，并投入了大量人力、物力进行研究，低聚糖也在替代抗生素作为饲料添加剂中成为主流。
低聚糖与其他促生长物质抗生素、益生菌相比具有无任何毒副作用、无污染、不残留、不产生耐药性、耐高温、性质稳定、加工储运过程中损失小等优点。在畜牧生产及饲料中具有重要的应用价值和较大发展潜力，被视为新型绿色、环保型饲料添加剂。
2012年12月的“速生鸡”事件一经曝光后，引起消费者的广泛关注。抗生素在动物饲料里添加的数量也将越来越引起国家的重视，饲料公司也开始寻找有相似功效的添加剂。目前，我国饲料中添加低聚糖才刚刚起步。其中因低聚异麦芽糖产量大，价格最低，成为最容易被饲料公司接受的饲料用低聚糖。以国内2012年2.1亿吨饲料为基准，假设低聚糖添加比例为0.4%，保守估计，3年之内饲料添加低聚糖的比例仅达到5%，则年需低聚糖产量为4.2万吨。
